Για την εκπαίδευση των φοιτητών του σε θέματα ανάπτυξης Λογισμικού και Επιστήμης των Υπολογιστών, το τμήμα διαθέτει 8 εργαστηριακούς χώρους εξοπλισμένους με σύγχρονα υπολογιστικά συστήματα (τουλάχιστον με επεξεργαστές i5) και Λογισμικά (ανοικτού κώδικα ως επί το πλείστον). Πιο συγκεκριμένα υπάρχουν τα ακόλουθα εργαστήρια:
1) Εργαστήριο-1 με 19 θέσεις εργασίας,
2) Εργαστήριο-2 με 21 θέσεις εργασίας,
3) Εργαστήριο-3 με 16 θέσεις εργασίας,
4) Εργαστήριο-4 με 20 θέσεις εργασίας,
5) Εργαστήριο-6 με 27 θέσεις εργασίας,
6) Εργαστήριο ΠΚ5 με 13 θέσεις εργασίας,
7) Εργαστήριο ΠΚ3 με 13 θέσεις εργασίας.
8) Εξειδικευμένο Εργαστήριο Τομέα ΣΗΕ για τη διδασκαλία Υπολογιστικών Μαθημάτων με κατάλληλες άδειες και συνολικά 19 θέσεις εργασίας.